隨著基因組學(xué)的發(fā)展，攻克癌癥這個(gè)夢(mèng)想會(huì)在不遠(yuǎn)的將來(lái)實(shí)現(xiàn)。韋順達(dá)源攜手華大基因，提供最專業(yè)的基因檢測(cè)和篩查。

癌細(xì)胞在人體內(nèi)的“破壞之旅”，是從一顆“種子”開(kāi)始——最開(kāi)始單個(gè)細(xì)胞發(fā)生突變，并不斷復(fù)制產(chǎn)生惡性細(xì)胞群，還能頑強(qiáng)抵抗人體自身免疫系統(tǒng)的監(jiān)督，形成惡性腫瘤。如果這時(shí)腫瘤被發(fā)現(xiàn)，醫(yī)生將通過(guò)手術(shù)或化療方法嘗試清除。盡管已如此兇險(xiǎn)，但這還不是終點(diǎn)——如果惡性腫瘤沒(méi)有得到有效克制，復(fù)制還將繼續(xù)下去，惡性腫瘤細(xì)胞將擴(kuò)散至全身，導(dǎo)致手術(shù)無(wú)效、大劑量的化療也僅能抑制的地步。

以傳統(tǒng)的醫(yī)學(xué)視角看癌癥，它是一種讓人不禁一聲嘆息的頑疾，但隨著基因組學(xué)的發(fā)展，分子層面的癌癥研究讓我們對(duì)這一“絕癥”的了解越來(lái)越多，在未來(lái)預(yù)防、治愈癌癥不一定只是美好的期待而已。

基因組學(xué)對(duì)癌癥的新認(rèn)識(shí)

同一類(lèi)型的癌癥，從古到今是否都一樣？對(duì)每一位患者的影響相同嗎？基因組學(xué)研究告訴你，癌細(xì)胞比我們?cè)日J(rèn)為的更有活力和異質(zhì)性。

和大家分享英國(guó)倫敦癌癥研究所的Marco Gerlinger博士2012年發(fā)表在New England Journal of Medicine的研究成果。Marco Gerlinger博士認(rèn)為我們可以將癌癥視為癌細(xì)胞的異質(zhì)性集合，這些癌細(xì)胞不斷進(jìn)化，甚至可能為爭(zhēng)取生存權(quán)和發(fā)展權(quán)而發(fā)生競(jìng)爭(zhēng)，而代價(jià)是宿主的健康乃至生命。

Gerlinger博士和同事對(duì)4例進(jìn)展期腎癌患者的原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶標(biāo)本進(jìn)行了多個(gè)時(shí)間點(diǎn)的基因組分析（化療開(kāi)始之前和癌癥進(jìn)展過(guò)程中），包括全外顯子組測(cè)序，或所有已知人類(lèi)基因的DNA測(cè)序。此外，他們還觀察同一時(shí)間點(diǎn)、同一標(biāo)本的不同區(qū)域，尋找惡性腫瘤組織。

研究結(jié)果顯示，檢測(cè)出的突變多數(shù)并非所有腫瘤標(biāo)本所共有，區(qū)域差異在腫瘤中相當(dāng)普遍，而且有些突變出現(xiàn)次數(shù)多于一次，正是“趨同進(jìn)化”的表現(xiàn)。癌細(xì)胞會(huì)在多樣的自然選擇壓力（或許包括化療暴露）下發(fā)生有利于自身生長(zhǎng)和繁殖的適應(yīng)性改變，這一結(jié)論意味著每例患者的每個(gè)腫瘤都具有獨(dú)特的基質(zhì)，而且還是多個(gè)獨(dú)特的癌細(xì)胞群體的集合。

由此看來(lái)，每個(gè)癌癥是獨(dú)一無(wú)二的，甚至同一個(gè)人的同一個(gè)癌癥也在不斷進(jìn)化。這種變異可能解釋為何化療并不是總能根治腫瘤，也告訴我們可以針對(duì)具有異質(zhì)性且不斷進(jìn)化的腫瘤制定個(gè)性化的治療方案。而這一切依賴基因組學(xué)研究的進(jìn)一步深入。

癌癥基因組相關(guān)計(jì)劃

人類(lèi)基因組計(jì)劃的完成為眾多臨床醫(yī)學(xué)研究帶來(lái)了新方法。既然癌癥與基因有關(guān)，那么想辦法發(fā)現(xiàn)癌癥的致病基因，將是癌癥診療的可靠依據(jù)。

2013年12月，人類(lèi)基因組計(jì)劃的領(lǐng)導(dǎo)者之一、哈佛與麻省下屬的Broad Institute院長(zhǎng)Eric Lander在接受The Atlantic的采訪中指出，隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，測(cè)序成本大幅下降，在未來(lái)的五六年內(nèi)，我們將有可能獲得疾病基因的完整目錄。（The Atlantic “When Will Genomics Cure Cancer?”）現(xiàn)在，乳腺癌、宮頸癌、胃癌、肺癌、膀胱癌、結(jié)直腸癌等的檢測(cè)均獲得突破，科學(xué)家們逐漸了解到，是哪些基因的突變?cè)斐闪税┌Y的發(fā)生。

實(shí)際上，研究者們對(duì)癌癥基因組的探究早已開(kāi)始。

2005年，美國(guó)啟動(dòng)了一項(xiàng)旨在繪制人類(lèi)癌癥基因組圖譜的研究計(jì)劃(TCGA)，期待通過(guò)全面檢測(cè)腫瘤發(fā)生過(guò)程中所有的遺傳學(xué)變化，繪制出各種癌癥基因異常的所有特征，進(jìn)一步了解基因突變與癌癥之間的內(nèi)在聯(lián)系，便于深入的研究和對(duì)癥的治療。

2006年，癌癥基因組剖析計(jì)劃（CGAP）項(xiàng)目啟動(dòng)，由人類(lèi)基因組計(jì)劃負(fù)責(zé)人、NIH院長(zhǎng)Francis Collins提出，旨在DNA序列水平上找到與癌癥相關(guān)的DNA變異，幫助人類(lèi)真正破解癌癥致病的機(jī)理。據(jù)Francis Collins稱，“因?yàn)槊垦芯恳环N癌癥都需要收集幾百個(gè)樣本，以期通過(guò)分析找出真正致癌的原因”，這一創(chuàng)新性研究計(jì)劃的規(guī)模相當(dāng)于1000個(gè)、甚至10000個(gè)人類(lèi)基因組計(jì)劃。

同年，在杭州舉行的首屆國(guó)際基因組學(xué)大會(huì)（ICG）上，F(xiàn)rancisCollins正式邀請(qǐng)中國(guó)加入國(guó)際癌癥基因組計(jì)劃，中、英、美、印四國(guó)科學(xué)家都表示愿意把全球腫瘤基因組計(jì)劃在未來(lái)研究中所獲得的所有樣品、突變基因序列等成果“公開(kāi)、共有、共享”。

除此之外，人類(lèi)癌癥基因組計(jì)劃（HCGP）、癌癥基因組計(jì)劃（CGP）等多項(xiàng)針對(duì)癌癥攻克的計(jì)劃已取得令人矚目的成果。

國(guó)際癌癥基因組聯(lián)盟（ICGC）

2008年，國(guó)際癌癥基因組聯(lián)盟（ICGC）將利用高速技術(shù)檢驗(yàn)?zāi)[瘤細(xì)胞的DNA，其目標(biāo)是在2020年前找到所有導(dǎo)致細(xì)胞癌變的基因。聯(lián)盟成員包括澳大利亞、加拿大、中國(guó)、歐盟、法國(guó)、印度、日本、新加坡、英國(guó)和美國(guó)，中國(guó)癌癥基因組學(xué)會(huì)（CCGC）是成員國(guó)家的協(xié)作機(jī)構(gòu)之一。

不同的國(guó)家分別負(fù)責(zé)不同類(lèi)別的癌癥基因組，中國(guó)負(fù)責(zé)破譯胃癌的基因組測(cè)序，日本負(fù)責(zé)破譯肝癌的基因組測(cè)序，印度負(fù)責(zé)口腔癌，美國(guó)負(fù)責(zé)腦癌、卵巢癌和胰腺癌等。此國(guó)際癌癥基因組計(jì)劃的目的是希望利用先進(jìn)、快速的基因組測(cè)序新技術(shù)，詳細(xì)研究50種不同種類(lèi)的癌癥，并希望找到所有與癌癥相關(guān)的基因突變，最終繪制出一張較為完整的致癌基因突變圖譜。

中國(guó)的癌癥基因組學(xué)研究

2012年12月5日，國(guó)際癌癥基因組聯(lián)盟（ICGC）宣布在中國(guó)發(fā)起四個(gè)新項(xiàng)目，主要對(duì)結(jié)直腸癌、食道癌、肝癌和鼻咽癌的驅(qū)動(dòng)基因進(jìn)行檢測(cè)，為實(shí)現(xiàn)個(gè)體化醫(yī)療奠定基礎(chǔ)。這四個(gè)新項(xiàng)目將由北京大學(xué)腫瘤研究所所長(zhǎng)呂有勇教授和華大基因主席楊煥明院士提供科學(xué)指導(dǎo)。中國(guó)是ICGC的創(chuàng)始成員之一，在2008年時(shí)曾經(jīng)發(fā)起了胃癌基因組項(xiàng)目。

中國(guó)癌癥基因組聯(lián)盟（CCGC）合作計(jì)劃已經(jīng)形成了一個(gè)具有200多位精通新一代基因組測(cè)序以及生物信息學(xué)技術(shù)的科研人員網(wǎng)絡(luò)體系，以揭示癌癥的各種復(fù)雜起因。這四個(gè)新項(xiàng)目的研究人員來(lái)自北京、上海、廣州、深圳和香港等12個(gè)城市的19個(gè)醫(yī)院或研究所。

作為中國(guó)癌癥基因組聯(lián)盟的一員，華大基因已經(jīng)陸續(xù)完成了宮頸癌、乳腺癌、腎上腺皮質(zhì)腫瘤、食管鱗癌、胰島素瘤、泌尿系統(tǒng)腫瘤、膀胱癌、直腸癌、肝癌、腎透明細(xì)胞癌等多種癌癥的全基因組分析，定位突變基因，為癌癥的診斷和治療提供新思路。

華大基因還與Coimbra基因聯(lián)合發(fā)起胃癌基因組研究計(jì)劃，解開(kāi)胃癌背后的遺傳奧秘；與丹麥哥本哈根大學(xué)等研究機(jī)構(gòu)組成跨國(guó)、跨學(xué)科的合作研究機(jī)構(gòu)，針對(duì)乳腺癌進(jìn)行深入的研究，改進(jìn)乳腺癌的預(yù)測(cè)、預(yù)防和治療；2012年和亞洲癌癥研究組織（ACRG）開(kāi)展肺癌和肝癌的基因組學(xué)研究，建立藥物基因組癌癥數(shù)據(jù)庫(kù)，加速藥物發(fā)現(xiàn)及癌癥治療新方法的研究。

自2006年Francis Collins在首屆國(guó)際基因組學(xué)大會(huì)（ICG）上正式邀請(qǐng)中國(guó)加入國(guó)際癌癥基因組計(jì)劃后，每屆國(guó)際基因組學(xué)大會(huì)（ICG）都會(huì)探討有關(guān)癌癥基因組的話題。第九屆ICG大會(huì)將于9月9日在深圳舉辦，癌癥基因組研究是大會(huì)議程中的熱點(diǎn)話題之一。

癌癥生物信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)資源

基因組

癌癥基因組計(jì)劃（Sanger中心）

類(lèi)型：癌癥基因調(diào)查統(tǒng)計(jì)、體細(xì)胞突變、失雜合圖譜、缺失圖譜、小的基因內(nèi)體細(xì)胞突變

網(wǎng)址：

http://www./genetics/CGP

美國(guó)人類(lèi)基因組資源（NCBI）

類(lèi)型：人類(lèi)基因組數(shù)據(jù)的整合信息資源

網(wǎng)址：

http://www.ncbi.nlm./genome/guide/human

Genome Browser（加州大學(xué)圣克魯茲分校）

類(lèi)型：可視化和查詢工具

網(wǎng)址：http://genome.

核型

癌癥染色體（NCBI）

類(lèi)型：SKY/M-FISH and CGH數(shù)據(jù)庫(kù)、Mitelman數(shù)據(jù)庫(kù)、癌癥NCI周期性畸變

網(wǎng)址：

http://www.ncbi.nlm./entrez/query.fcgi?db=cancerchromosomes

Progenetix（佛羅里達(dá)大學(xué)）

類(lèi)型：不同癌癥類(lèi)型的CGH數(shù)據(jù)庫(kù)

網(wǎng)址：http://www.

單核苷酸多態(tài)性

NCBI的單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(kù)

類(lèi)型：單核苷酸多態(tài)性

網(wǎng)址：

http://www.ncbi.nlm.projects/SNP

SNP500cancer（NCBI）

類(lèi)型：癌癥流行病學(xué)有關(guān)的單核苷酸多態(tài)性

網(wǎng)址：http://snp500cancer.nci.

基因表達(dá)

NCBI的基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)

類(lèi)型：基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)瀏覽、搜索和數(shù)據(jù)檢索的策劃資源

網(wǎng)址：http://www.ncbi.nlm./geo

Oncomine（美國(guó)密歇根大學(xué)）

類(lèi)型：定位、搜索和可視化某種基因或癌癥類(lèi)型的工具

網(wǎng)址：

http://141.214.6.50/oncomine/main/index.jsp

癌腫基因組解剖計(jì)（CGAP）

類(lèi)型：基因、染色體畸變、SNP 500cancer、組織、SAGE表達(dá)材料（正常的、癌癥前期生物和癌細(xì)胞的）整合資源

網(wǎng)址：http://cgap.nci.

臨床基因組

癌癥的分子水平分析計(jì)劃（CMAP）

類(lèi)型：分子表達(dá)譜、靶標(biāo)、靶向藥物和測(cè)試

網(wǎng)址：http://cmap.nci.