Python下大多數(shù)工具包的安裝都很簡(jiǎn)單，只需要執(zhí)行 “python setup.py install”命令即可。然而，由于SciPy和numpy這兩個(gè)科學(xué)計(jì)算包的依賴關(guān)系較多，安裝過(guò)程較為復(fù)雜。網(wǎng)上教程較為混亂，而且照著做基本都不能用。在仔細(xì)研讀各個(gè)包里的README和INSTALL之后，終于安裝成功?，F(xiàn)記錄如下。

系統(tǒng)環(huán)境：

OS：RedHat5

Python版本：Python2.7.3

gcc版本：4.1.2

各個(gè)安裝包版本：

scipy-0.11.0

numpy-1.6.2

nose-1.2.1

lapack-3.4.2

atlas-3.10.0

依賴關(guān)系：scipy的安裝需要依賴于numpy、lapack、atlas（后兩者都是線性代數(shù)工具包，不清楚的自行g(shù)oogle之。。。），而numpy和sci的測(cè)試程序的運(yùn)行又依賴于nose，因此，整個(gè)安裝過(guò)程必須要按順序執(zhí)行的，否則是無(wú)法執(zhí)行下去的。

安裝步驟：

1、安裝nose

這個(gè)安裝比較簡(jiǎn)單，解壓縮nose的安裝文件，進(jìn)入nose的目錄，直接運(yùn)行setup.py即可：

tar -zxvf nose-1.2.1.tar.gz

cd nose-1.2.1

python setup.py install

2、安裝lapack

由于最新版本的ATLAS可以直接集成lapack的安裝壓縮文件進(jìn)行編譯，因此，如果僅在python下使用的話，可以不用安裝lapack。只需要下載壓縮文件：lapack-3.4.2.tgz 即可。

3、安裝ATLAS

這個(gè)的安裝主要是配置一些選項(xiàng)，包括配置成64位庫(kù)文件、位置無(wú)關(guān)的以及共享的鏈接庫(kù)。詳細(xì)的配置說(shuō)明在atlas安裝包 doc/ 下的pdf文件中。可查閱。

下面是我的安裝過(guò)程：

tar -jxvf atlas3.10.0.tar.bz2

cd ATLAS

mkdir obj64

../configure -b 64 -Fa alg -fPIC -shared --prefix=/配置atlas的安裝路徑/atlas --with-netlib-lapack-tarfile=/lapack安裝壓縮文件存放的目錄/lapack-3.4.2.tgz

(注：這個(gè)配置時(shí)間非常長(zhǎng)，在Core i7 處理上，大概1個(gè)小時(shí)左右)

make

（下面是一些檢查過(guò)程，保證沒(méi)有問(wèn)題之后再進(jìn)行安裝）

make check

make time

make install

至此，atlas安裝完成。不過(guò)我們要記錄下編譯過(guò)程中所用的fortran編譯器類型，這個(gè)信息在下面安裝numpy和scipy的時(shí)候要用。還是在目錄 obj64/ 下，執(zhí)行

fgrep "F77 =" Make.inc
可以看到  F77 = gfortran
記下這個(gè)編譯器類型 gfortran.

4、安裝numpy

numpy和scipy的安裝過(guò)程都要顯式的指明所用fortran編譯器的類型，而且要與前面編譯atlas時(shí)一致（在本文中即：gfortran），這一點(diǎn)非常重要，否則很多功能都會(huì)出錯(cuò)。

首先配置numpy目錄下的site.cfg文件，指明atlas庫(kù)的位置：

tar -zxvf numpy-1.6.2.tar.gz

cd numpy-1.6.2

cp site.cfg.example site.cfg

vim site.cfg

配置成如下格式：

[DEFAULT]
library_dirs = /usr/local/lib:/atlas的安裝目錄/atlas/lib
include_dirs = /usr/local/include:/atlas的安裝目錄/include

[blas_opt]
libraries = f77blas, cblas, atlas

[lapack_opt]
libraries = lapack, f77blas, cblas, atlas

[amd]
amd_libs = amd
[umfpack]
umfpack_libs = umfpack

接下來(lái)配置安裝numpy所需要的Fortran編譯器類型：

如果前面得到的Fortran編譯器是gfortran的話，執(zhí)行：

 python setup.py build --fcompiler=gnu95

如果前面得到的Fortran編譯器是g77的話，執(zhí)行：

 python setup.py build --fcompiler=gnu

然后執(zhí)行

python setup.py install

安裝完成

5、安裝scipy

與安裝numpy類似：

tar -zxvf scipy-0.11.0.tar.gz

cd scipy-0.11.0

vim site.cfg

配置成如下格式：

[DEFAULT]
library_dirs = /usr/local/lib:/atlas的安裝目錄/atlas/lib
include_dirs = /usr/local/include:/atlas的安裝目錄/include

[blas_opt]
libraries = f77blas, cblas, atlas

[lapack_opt]
libraries = lapack, f77blas, cblas, atlas

[amd]
amd_libs = amd
[umfpack]
umfpack_libs = umfpack

接下來(lái)配置安裝numpy所需要的Fortran編譯器類型：

如果前面得到的Fortran編譯器是gfortran的話，執(zhí)行：

 python setup.py build --fcompiler=gnu95

如果前面得到的Fortran編譯器是g77的話，執(zhí)行：

 python setup.py build --fcompiler=gnu

然后執(zhí)行

python setup.py install

安裝完成

然后可以在python下執(zhí)行相應(yīng)的測(cè)試程序：

python

>>> import nose

>>> import numpy

>>> import scipy

>>> numpy.test('full')

等待。。。。

>>> scipy.test('full')

到這里，整個(gè)安裝過(guò)程結(jié)束。