本工具專門用來繪制火山圖，可以自由定制顏色，橫軸縱軸的最大最小值，導(dǎo)出發(fā)表級(jí)的圖片。

軟件輸入只需兩列，一列為foldchang（有沒有做log2轉(zhuǎn)換即可），一列為p值（有沒有l(wèi)og皆可）

軟件界面如下：

導(dǎo)出PDF結(jié)果如下：

火山圖繪制工具下載鏈接：http://gap./tool/5/（點(diǎn)擊閱讀原文前往下載）

1、首先我們選擇一套GEO數(shù)據(jù)集GSEXXXX,然后使用GEO2R的在線工具（或者使用生信人的差異分析小工具*看這里：如何極其簡單的使用GEO數(shù)據(jù)來做差異分析）篩選差異表達(dá)基因，我們將得到所有基因的差異表達(dá)情況，比如GEO2R輸出的GEO2R processing request....txt文件。

文件格式：

2、打開火山圖繪制工具軟件

3、導(dǎo)入數(shù)據(jù)點(diǎn)擊繪制

4、改改顏色，改改CutFC或者CutPvalue，還有X,Y軸的最大最小值，反正都可以試一下

5、導(dǎo)出PDF,就好了，最終結(jié)果如下：