請戴上耳機(jī)聆聽婷聲音 文章結(jié)構(gòu) 1. 上期內(nèi)容總結(jié),本期內(nèi)容概要 2. MicroLC在非靶向研究中的應(yīng)用 3. MicroLC在工業(yè)化、大樣本量蛋白定量中的應(yīng)用 4. MicroLC技術(shù)發(fā)展的挑戰(zhàn) 5.SCIEX公司在MicroLC產(chǎn)品發(fā)展上的努力 6. 總結(jié) 容介 很高興又見面了! 上期中我和大家聊了聊,和常規(guī)流速HPLC比較(為了介紹方便,本文中的HPLC都特指常規(guī)流速HPLC),MicroLC在靶向定量中對靈敏度的提高。通過兩方面應(yīng)用案例的分享, 大家了解到兩個方面的內(nèi)容:1是MicroLC能提高大部分ESI源檢測化合物的靈敏度,特別是肽類化合物;2是當(dāng)上百種化合物同時測定時,MicroLC也能幫助69%的化合物,靈敏度提高2-20倍,從而提高了實際樣本的目標(biāo)化合物檢出覆蓋率; 至于MicroLC能將S/N提高多少倍,則需要考慮化合物的基質(zhì)干擾和本底噪音的情況,低本底噪音的化合物更有可能獲得良好的S/N。 本期是上期內(nèi)容的姊妹篇,將從兩個角度介紹MicroLC, 一方面是: MicroLC是否能應(yīng)用于非靶向研究? 另一方面是: 與NanoLC比較,MicroLC在工業(yè)化、大樣本量蛋白組學(xué)研究中的應(yīng)用。又相關(guān)應(yīng)用需求的同志們,可以仔細(xì)聽一聽了。 第一個方面,在靶向檢測中,和常規(guī)流速HPLC比較,MicroLC提高了靈敏度。那自然而然的應(yīng)用需求就產(chǎn)生了,非靶向研究也需要提高靈敏度,但MicroLC是否有足夠好的RT穩(wěn)定性和噴霧穩(wěn)定性,來完成非靶向研究呢?一篇測試文獻(xiàn)[5],給出了答案,MicroLC聯(lián)用高分辨質(zhì)譜進(jìn)行非靶向脂質(zhì)組學(xué)研究,樣本運行時間7.5 min,5針人血漿樣品重復(fù)進(jìn)樣,上千種脂質(zhì)化合物的RT的CV偏差為0.01%--0.18%,質(zhì)譜峰強(qiáng)度CV偏差為2.9%-18%,完全符合非靶向組學(xué)方法要求。 圖1. MicroLC組學(xué)樣品應(yīng)用:A)非靶向脂質(zhì)組學(xué)【1】,展示部分脂質(zhì)內(nèi)標(biāo)MicroLC條件下的S/N提高, 實驗結(jié)果表明:13個脂質(zhì)內(nèi)標(biāo)S/N平均提高24倍;B)人血漿樣本重復(fù)進(jìn)樣5次,色譜圖RT (CV% 0.01%-0.18%) 和質(zhì)譜峰強(qiáng)度(CV% 2.9%-18%)展示良好穩(wěn)定性。 這里,分享一個MicroLC在代謝組學(xué)應(yīng)用的實際案例。作者Yan[2]研究六種紅酒的多酚代謝組學(xué),質(zhì)譜使用非靶采集模式,液相使用MicroLC,流速50uL/min, 4min的梯度,快速準(zhǔn)確鑒定165個多酚化合物,多維統(tǒng)計分析結(jié)果為多酚化合物和口感風(fēng)味的相關(guān)性提供了研究基礎(chǔ)。 第二個方面,上期和剛剛聊到的內(nèi)容一直集中在MicroLC對比常規(guī)流速HPLC性能而言;那么大家也會想到,和NanoLC比較,MicroLC通量提高后,靈敏度和穩(wěn)定性如何呢? 在蛋白組學(xué)研究中,為了提高樣本通量和降低檢測成本,適應(yīng)工業(yè)化、大批量樣本的蛋白組學(xué)研究要求,文獻(xiàn)作者Jakob【2】開發(fā)MicroLC-SWATH-MS方法(SWATH?技術(shù)是SCIEX公司的專利技術(shù),在后面的專欄中,我再為大家介紹這個技術(shù)),考察不同運行時間,對1750個酵母目標(biāo)蛋白定量。結(jié)果表明:5 μg酵母蛋白,在3 μL/min流速下,運行時間30 min,45 min和60 min,蛋白的檢出量分別為:1170個, 1322個,1470個,也就是分別檢出了目標(biāo)蛋白的67%,75%和81%;這一結(jié)果表明:使用MicroLC顯著縮短檢測時間后,靈敏度也能支持上千個蛋白被檢出。 另外,作者在5個月時間內(nèi),對327個酵母樣品進(jìn)行MicroLC分批采集,采用25 min的運行時間,對QC樣本中的750多個蛋白定量分析,結(jié)果表明:使用 MicroLC方法, 這750多個蛋白的批內(nèi)和批間標(biāo)準(zhǔn)偏差均<20%。最終,作者總結(jié)MicroLC-SWATH-MS方法無論是在測定性能還是在節(jié)省成本方面,非常適合工業(yè)化蛋白質(zhì)組學(xué)的研究。(這里補(bǔ)充一下,SWATH蛋白定量的通量取決于IDA鑒定的結(jié)果,實際工作中,建議使用二維液相,大大提高蛋白覆蓋率,也就能相應(yīng)提高定量通量了。) 圖2. 文獻(xiàn)作者Jakob【2】開發(fā)MicroLC-SWATH-MS方法:E). 1750個目標(biāo)酵母蛋白,進(jìn)不同μg酵母蛋白,MicroLC-SWATH-MS方法檢出蛋白個數(shù);F)MicroLC不同運行時間,1750個目標(biāo)酵母蛋白,檢出蛋白個數(shù);運行時間30 min,45 min和60 min,蛋白的檢出量分別為:1170個, 1322個,1470個;M) 展示327個酵母樣品,分3個批次,MicroLC-SWATH-MS采集的RT穩(wěn)定性;6個iRT肽段的平均保留時間標(biāo)準(zhǔn)差為17.7 s;N) MicroLC-SWATH-MS大序列樣本,不同時間RT穩(wěn)定性;P) 展示327個酵母樣品,分3批次進(jìn)樣,MicroLC-SWATH-MS批內(nèi)和批間的重現(xiàn)性,批內(nèi)大約為12%;批間為17.4%。 聽了上期和本期的案例分享,大家可能有個疑問。 既然MicroLC在靈敏度,通量,試劑和樣品消耗量上有這么多好處, 為什么MicroLC并沒有被廣泛應(yīng)用呢? 其實早在20多年前,科學(xué)界的專家們就意識到了MicroLC的技術(shù)優(yōu)勢,并發(fā)表了相關(guān)論文。但一個技術(shù)從出生到成熟,需要一個發(fā)展的過程。 以前,MicroLC的使用難點在于:1. 沒有專用,易于拆卸的微升流速的離子源或噴針,造成使用上的困難或噴霧不穩(wěn)定;您可能聽說過Nano源,但沒聽說過微升流速源,實際上,不同噴霧流速,合適的噴針內(nèi)徑和離子源設(shè)計對噴霧的穩(wěn)定至關(guān)重要。2. 難于更好地控制死體積,或突破性的設(shè)計保證系統(tǒng)的穩(wěn)定和易操作性;3. 微升色譜柱型號的匱乏和進(jìn)樣量的限制;但隨著科學(xué)界和工業(yè)界不斷地完善MicroLC及其相關(guān)產(chǎn)品設(shè)計和工藝,現(xiàn)在MicroLC技術(shù)取得了長足的發(fā)展。 我所在的SCIEX公司,也在不斷開發(fā)和革新MicroLC的硬件和軟性應(yīng)用。在去年ASMS(美國質(zhì)譜年會)上,推出了我們的第三代微升液相M5和與其相配套的OptiflowTM微升噴霧源。針對上述3個問題的解決,又向前邁進(jìn)了一大步。首先,更專業(yè),便于使用的OptiflowTM微升噴霧源使得測定結(jié)果更穩(wěn)定;其次,M5 系統(tǒng)使用更合理的管路設(shè)計,大大減少了死體積和使用者的不便;最后,Trap-Elute二維泵系統(tǒng)大大提高了樣品上樣量,助力靈敏度的提高。 婷視角——關(guān)于MicroLC微流液相色譜技術(shù) 根據(jù)上期和本期分享的內(nèi)容,我們可以總結(jié)出有下述三種應(yīng)用需求時,可以考慮試試MicroLC微流液相色譜技術(shù)。 1. 當(dāng)您有化合物靈敏度的困擾時; 2. 如果想提高靶向和非靶向代謝組學(xué)或脂質(zhì)組學(xué)的檢出覆蓋率時; 3. 工業(yè)大樣本量蛋白組學(xué)定量研究時。 最后,不要忘記實驗時,要使用對應(yīng)流速的離子源和噴針喲! |
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