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蛋白翻譯后修飾科普專題--走近N-糖基化

 bio_ww 2019-12-27
編者按:

糖基化作為生物體內(nèi)最重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾形式之一,可發(fā)生在細(xì)胞50%-70%的蛋白質(zhì)上,通過(guò)影響細(xì)胞識(shí)別、分化、黏附、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、免疫應(yīng)答等重要的生命活動(dòng)影響多種疾病的發(fā)生。免疫性疾病、先天性糖缺陷在內(nèi)的多達(dá)數(shù)十種的遺傳性疾病以及腫瘤均與糖基化異常或糖苷酶缺失有關(guān)。本文,小編繼續(xù)拋磚引玉簡(jiǎn)要總結(jié)一下糖基化修飾。


內(nèi)容分為五個(gè)模塊:


1. 糖基化修飾類型
2. N-糖基化修飾簡(jiǎn)述
3. N-糖鏈的合成、轉(zhuǎn)移、修飾
4. N-糖基化蛋白富集與糖鏈釋放
5. N-糖基化修飾功能簡(jiǎn)述


01
糖基化修飾類型

由于在結(jié)構(gòu)上,糖基化修飾具有宏觀不均一性(一個(gè)蛋白質(zhì)上有多個(gè)糖基化位點(diǎn),甚至是不同類型的糖基化位點(diǎn))和微觀不均一性(同一糖基化位點(diǎn)上可以連接不同類型的多糖),糖基化修飾研究相較于其他修飾更加困難。根據(jù)連接氨基酸殘基不同,糖基化主要分為 N-糖基化(可細(xì)分為高甘露糖型、復(fù)合型、雜合型)、O-糖基化(研究比較多的是 O-GalNAc、O-GlcNAc)、C-連接糖基化、糖基磷脂酰肌醇(GPI)錨四大類型。不同的修飾類型功能有所不同,其中研究最多的是 N-糖基化,O-糖基化次之。本文簡(jiǎn)單介紹一下 N-糖基化修飾。


圖1 N-糖基化修飾


02
N-糖基化修飾簡(jiǎn)述


N-連接糖基化(N-linked glycosylation) 是一種新生肽鏈的共翻譯或翻譯后修飾方式,糖鏈通過(guò)與新生肽鏈中特定天冬酰胺(N-X-S/T,XP)的自由-NH2 基連接,所以將這種糖基化稱為 N-連接的糖基化。N-糖基化的過(guò)程在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體中進(jìn)行。N-糖基化修飾主要包括 N-糖的合成、轉(zhuǎn)移修飾三個(gè)過(guò)程。N-糖的合成和轉(zhuǎn)移在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中進(jìn)行,其修飾過(guò)程在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體中都存在。另外,植物和哺乳動(dòng)物中 N-糖基化修飾存在差異[1]。



圖2 植物和動(dòng)物的蛋白質(zhì) N-糖基化過(guò)程及差異[1]


03
N-糖鏈的合成、轉(zhuǎn)移、修飾

合成:N-糖的合成起始于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜胞質(zhì)一側(cè),多萜醇(dolichol)首先經(jīng)過(guò)磷酸化活化,隨后在一系列糖基轉(zhuǎn)移酶作用下形成一個(gè)具有2分子 N-乙酰葡糖胺,9分子甘露糖和3分子葡萄糖的寡糖鏈,形成三天線結(jié)構(gòu)。


轉(zhuǎn)移:寡糖基轉(zhuǎn)移酶(oligosaccharyltransferase,OST)復(fù)合體將合成的寡糖鏈轉(zhuǎn)移至新生肽鏈中特定的天冬酰胺(N-X-S/T,XP上 。此天冬酰胺(N)所在的基序比較保守,天冬酰胺(N)的后一位氨基酸為除脯氨酸(P)以外的任意氨基酸(X),后兩位氨基酸主要是絲氨酸(S)與蘇氨酸(T),后兩位也存在其他氨基酸的可能,不過(guò)很少。值得注意的是,并不是所有的 N-X-S/T,XP 基序都能發(fā)生 N-糖基化修飾。


修飾:進(jìn)入高爾基體后,原來(lái)糖鏈上的大部分甘露糖被切除,但又由多種糖基轉(zhuǎn)移酶依次加上了不同類型的糖分子,形成了結(jié)構(gòu)各異的寡糖鏈。植物和哺乳動(dòng)物中蛋白質(zhì)的 N-糖基化模式不同,其差異主要出現(xiàn)在高爾基體階段[1]。根據(jù)五糖核心外圍糖鏈的延長(zhǎng)方式不同,N-糖基化修飾常分為三種類型:高甘露糖型、雜合型與復(fù)合型。


圖3 N-糖基化類型


04
N-糖基化蛋白富集與糖鏈釋放

為了提高糖肽鑒定到的數(shù)目,在質(zhì)譜檢測(cè)糖肽前,一般需要針對(duì)糖肽進(jìn)行特異性富集。


富集:
針對(duì) N-糖基化修飾肽段的富集方法有很多,比如凝集素富集、硼酸親和富集、親水色譜 HILIC 富集、肼化學(xué)富集等[2]。不同的富集方法,富集原理各有不同,各有優(yōu)缺點(diǎn),其中凝集素富集與 HILIC 富集應(yīng)用比較多。


凝集素是一種對(duì)糖蛋白上的糖類具有高度特異性的結(jié)合蛋白,種類有很多,不同的凝集素能夠?qū)R恍缘刈R(shí)別特定的單糖結(jié)構(gòu)、糖基序列或糖苷鍵,并與之可逆結(jié)合。不同的凝集素組合使用,可以實(shí)現(xiàn)全糖蛋白/糖肽的富集。HILIC 富集采用極性固定相和非極性流動(dòng)相的色譜技術(shù),利用糖肽和糖鏈的親水性進(jìn)行分離。


糖鏈釋放:

純化后的糖蛋白樣品即可進(jìn)行糖鏈釋放,多糖釋放一般有酶釋放化學(xué)釋放兩種方法。酶釋放法動(dòng)物樣本常用肽 N- 糖苷酶F(PNGase F),PNGase F 可以將糖鏈從天冬酰胺上切除,同時(shí)可以使天冬酰胺轉(zhuǎn)變?yōu)樘於彼?,造成相?duì)分子質(zhì)量增加0.9847 Da,若是在重水中,引入 O18,增加2.9847Da,從而起到質(zhì)量標(biāo)記 N 糖基化位點(diǎn)的作用。化學(xué)法主要是肼解法,此法反應(yīng)條件比較劇烈,會(huì)破壞糖鏈自身結(jié)構(gòu),而且蛋白部分已經(jīng)破壞,無(wú)法進(jìn)行糖基化位點(diǎn)的相關(guān)研究。



圖4 凝集素富集,PNGase F 釋放,質(zhì)譜檢測(cè)流程圖


05
N-糖基化修飾功能簡(jiǎn)述


N-糖基化修飾對(duì)于蛋白質(zhì)的正確折疊、功能定位、胞內(nèi)運(yùn)輸等起著重要作用,在哺乳動(dòng)物中,N-糖基化對(duì)于調(diào)節(jié)胚胎發(fā)育[3]、癌癥發(fā)生發(fā)展和免疫防御等具有重要意義。在植物中,N-糖基化對(duì)于細(xì)胞壁的形成[4]、生殖發(fā)育[5]和抵御病原菌入侵[6] 等諸多生理過(guò)程具有重要意義。下面對(duì) N-糖基化在免疫系統(tǒng)與腫瘤中的研究進(jìn)行簡(jiǎn)述。


圖5 N-糖基化蛋白質(zhì)組的應(yīng)用方向


蛋白質(zhì)糖基化或聚糖影響免疫細(xì)胞和免疫分子的結(jié)構(gòu)與功能,影響機(jī)體對(duì)抗原的應(yīng)答反應(yīng)。免疫系統(tǒng)中多數(shù)分子都是糖蛋白,如免疫球蛋白、細(xì)胞因子、補(bǔ)體、分化抗原、黏附分子和 MHC 分子[7]。針對(duì)免疫系統(tǒng)分子的糖基化研究,比較適合疾病標(biāo)志物研究。甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)便是一種已被廣泛應(yīng)用于肝癌早期臨床診斷的血清糖蛋白。免疫球蛋白 G(IgG)是機(jī)體抗感染免疫的主力抗體,IgG 的糖基化修飾會(huì)影響其與 Fc 受體或補(bǔ)體 C1q 結(jié)合,進(jìn)而影響 IgG 的生物活性及生物學(xué)功能[8]。該蛋白質(zhì)在不同的生理和病理?xiàng)l件下,糖基化修飾會(huì)發(fā)生改變[2,8],比如,風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)--IgG 半乳糖及唾液酸殘基減少[9,10];免疫介導(dǎo)性骨質(zhì)疏松--唾液酸殘基減少[11];胃癌--半乳糖及唾液酸減少,核心巖藻糖增加[12,13]


圖6 人源 IgG 的不同水解片段上的糖鏈分布[8]


糖基化可以調(diào)控腫瘤的增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移和血管生成[14,15],糖基化異常常被認(rèn)為是癌癥的標(biāo)志[16],F(xiàn)DA 批準(zhǔn)的大多數(shù)腫瘤標(biāo)志物都是糖蛋白或聚糖抗原[17-19]。


N-聚糖支化的程度可以通過(guò)調(diào)節(jié)生長(zhǎng)因子受體(EGFR,F(xiàn)GFR,PDGF 等)的活性和信號(hào)傳導(dǎo),進(jìn)而影響腫瘤細(xì)胞的增殖 [20-23]

正常細(xì)胞可以通過(guò)糖基化受體和聚糖結(jié)合蛋白之間的相互作用調(diào)節(jié)凋亡機(jī)制,癌細(xì)胞可以破壞此機(jī)制從而逃避死亡[24,25],比如,在正常細(xì)胞中 GD3 的增加通常會(huì)誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,但在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中,在 GD3 末端唾液酸中添加乙?;鶗?huì)使 GD3 無(wú)法誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,從而促進(jìn)腫瘤存活[26]。


糖基化可以以各種途徑影響腫瘤的侵襲與轉(zhuǎn)移。癌細(xì)胞通常具有高水平的唾液酸化 [27],唾液酸化作用的增加會(huì)增加局部負(fù)電荷,從而物理破壞細(xì)胞間粘附,并通過(guò)靜電排斥促進(jìn)從腫瘤塊中脫離增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞的侵襲[28]。亦可通過(guò)影響跨膜糖蛋白 E-鈣黏著蛋白的 N-聚糖鏈結(jié)構(gòu)導(dǎo)致其蛋白定位錯(cuò)誤進(jìn)而影響腫瘤細(xì)胞粘附[29,30]。


總體而言,癌癥進(jìn)程中的遺傳、表觀遺傳、代謝、炎性和微環(huán)境機(jī)制改變與糖基化修飾改變密切相關(guān),對(duì)這些聚糖修飾的深入研究將進(jìn)一步有助于解釋癌細(xì)胞相互作用、細(xì)胞外通訊(包括細(xì)胞外囊泡和胞外通訊)和癌癥免疫[31]。

圖7 聚糖在癌癥發(fā)展和進(jìn)展中的作用[31]


N-糖基化淺談至此,敬陳管見(jiàn)。糖基化在生命領(lǐng)域的奧秘,仍有待廣大科研工作者去追尋~

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