根據(jù)《財政部 稅務(wù)總局 科技部關(guān)于企業(yè)委托境外研究開發(fā)費(fèi)用稅前加計扣除有關(guān)政策問題的通知》（財稅〔2018〕64號）的相關(guān)規(guī)定，企業(yè)委托境外進(jìn)行研發(fā)活動所發(fā)生的費(fèi)用，按照費(fèi)用實際發(fā)生額的80%計入委托方的委托境外研發(fā)費(fèi)用，只要委托境外研發(fā)費(fèi)用不超過境內(nèi)符合條件的研發(fā)費(fèi)用三分之二的部分，可以按規(guī)定在企業(yè)所得稅稅前加計扣除。
因此，你公司應(yīng)按費(fèi)用實際發(fā)生額的80%，即50*80%=40萬元計入委托方的委托境外研發(fā)費(fèi)用。其中不超過境內(nèi)符合條件的研發(fā)費(fèi)用三分之二的部分，可以按照規(guī)定在企業(yè)所得稅稅前加計扣除。企業(yè)在年度申報享受優(yōu)惠時，應(yīng)按照《國家稅務(wù)總局關(guān)于發(fā)布修訂后的<企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策事項辦理辦法>的公告》（國家稅務(wù)總局公告2018年第23號）的規(guī)定辦理有關(guān)手續(xù)，并留存?zhèn)洳橄嚓P(guān)資料。
