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Graphpad prism繪制柱狀圖-2組數(shù)據(jù)

 紐萬生物科技 2022-11-25 發(fā)布于廣東

軟件:Graphpad prism 9

數(shù)據(jù):以qpcrR2-△△Ct值為例(2組,每組10個生物學重復樣本)

C

T

1.00

0.45

0.80

0.56

0.87

0.49

1.01

0.64

0.71

0.51

0.92

0.42

0.78

0.30

1.13

0.54

1.07

0.62

1.10

0.65

方法:

1. 打開Graphpad prism 9,選擇Column

2. 復制qpcrR2-△△Ct數(shù)據(jù),粘貼

3. 找到Graphs(圖),點擊以上數(shù)據(jù)對應的名稱,就會出現(xiàn)圖形了

4. 選擇圖形,圖形有Individual values,Box and violin,Mean/median & error,可以選擇自己喜歡的圖形,這里選擇Individual values中的第二個,如下圖;plot選擇“mean with SEM”(均數(shù)加減標準誤),SEM為標準誤,與SD關系為SEM=SD/Sqrt(n),因此SEM會遠小于SD,作圖會更好看些

 

5. 接下來是調整圖形的顏值,

1)調整命名,如刪除Data1Xtitle標題,點擊Y軸重新命名

2)通過change版塊調整

:更換圖表類型;

:調整圖形的大小

:選擇colors,默認選擇藍色和紅色

:改變X軸和Y軸的信息

:改變柱子的外觀

我們根據(jù)以上方法,按照自己喜歡的風格,得到的圖形如下:

 

6. 統(tǒng)計學分析

1)確定統(tǒng)計方法

2)需要確定是否符合正態(tài)分布:

點擊Analysis,選擇Column analyses——選擇Normality and Lognormality Tests,即正態(tài)性檢驗

  

3. 看正態(tài)分布檢測結果,一般認為,P>0.05時,數(shù)據(jù)符合正態(tài)分布。這里有幾個檢測,都滿足了正態(tài)分布,可以考慮用參數(shù)檢驗中的t檢驗(如果不滿足,則選擇非參數(shù)檢驗)

備注:結果列表中,當幾種檢驗不一致時,小樣本以shaprio-wilk test為準,大樣本以kolmogorov-smimov test為準。

4. 點擊Analysis,選擇Column analyses——選擇t tests(and nonparametric tests)T檢驗或者非參數(shù)檢驗

  

Paired:同一個對象處理/給藥前后的差異

Unpaid:兩組比較,例如對照組vs實驗組

5. 查看結果,P>0.05,故滿足方差齊性。(注意,如果不符合方差齊性,需要重新進行T檢驗,choose test選擇Wech’s矯正,再重復一次分析)

6. 顯著性分析結果

7. 顯著性分析結果作圖,prism 9以上的版本,可選擇自動增加顯著性分析作圖Draw-Automatically add painwise comparisons,然后保存圖片即可,建議保存矢量圖格式,如PDF,也方便后續(xù)在AI上編輯。


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