軟件:Graphpad prism 9 數(shù)據(jù):以qpcr的R2-△△Ct值為例(2組,每組10個生物學重復樣本)
方法: 1. 打開Graphpad prism 9,選擇Column 2. 復制qpcr的R2-△△Ct數(shù)據(jù),粘貼 3. 找到Graphs(圖),點擊以上數(shù)據(jù)對應的名稱,就會出現(xiàn)圖形了 4. 選擇圖形,圖形有Individual values,Box and violin,Mean/median & error,可以選擇自己喜歡的圖形,這里選擇Individual values中的第二個,如下圖;plot選擇“mean with SEM”(均數(shù)加減標準誤),SEM為標準誤,與SD關系為SEM=SD/Sqrt(n),因此SEM會遠小于SD,作圖會更好看些
5. 接下來是調整圖形的顏值, (1)調整命名,如刪除Data1和Xtitle標題,點擊Y軸重新命名 (2)通過change版塊調整 :更換圖表類型; :調整圖形的大小 :選擇colors,默認選擇藍色和紅色 :改變X軸和Y軸的信息 :改變柱子的外觀 我們根據(jù)以上方法,按照自己喜歡的風格,得到的圖形如下:
6. 統(tǒng)計學分析 (1)確定統(tǒng)計方法 (2)需要確定是否符合正態(tài)分布: 點擊Analysis,選擇Column analyses——選擇Normality and Lognormality Tests,即正態(tài)性檢驗
3. 看正態(tài)分布檢測結果,一般認為,P>0.05時,數(shù)據(jù)符合正態(tài)分布。這里有幾個檢測,都滿足了正態(tài)分布,可以考慮用參數(shù)檢驗中的t檢驗(如果不滿足,則選擇非參數(shù)檢驗) 備注:結果列表中,當幾種檢驗不一致時,小樣本以shaprio-wilk test為準,大樣本以kolmogorov-smimov test為準。 4. 點擊Analysis,選擇Column analyses——選擇t tests(and nonparametric tests)即T檢驗或者非參數(shù)檢驗
Paired:同一個對象處理/給藥前后的差異 Unpaid:兩組比較,例如對照組vs實驗組 5. 查看結果,P值>0.05,故滿足方差齊性。(注意,如果不符合方差齊性,需要重新進行T檢驗,choose test選擇Wech’s矯正,再重復一次分析) 6. 顯著性分析結果 7. 顯著性分析結果作圖,prism 9以上的版本,可選擇自動增加顯著性分析作圖Draw-Automatically add painwise comparisons,然后保存圖片即可,建議保存矢量圖格式,如PDF,也方便后續(xù)在AI上編輯。 如需獲取更多技術資料,可關注華丘生物官網(wǎng):www. |
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