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臨床腫瘤科室如何哪些常見的公共數(shù)據(jù)庫(kù)可以寫文章?今天來(lái)個(gè)初步匯總

 妙趣橫生統(tǒng)計(jì)學(xué) 2024-07-24 發(fā)布于江蘇
想發(fā)論文但沒數(shù)據(jù),又沒時(shí)間,沒條件做試驗(yàn),臨床醫(yī)生,腫瘤方面的專家學(xué)者,公衛(wèi)、生信、遺傳方面的學(xué)者都可以用這些公共數(shù)據(jù)庫(kù)分析癌癥人群數(shù)據(jù),做到零試驗(yàn)發(fā)文!
說到癌癥人群的公共數(shù)據(jù)庫(kù),諸位最熟悉的不過是SEER數(shù)據(jù)庫(kù)了吧!其實(shí)我們常見的,常用的數(shù)據(jù)庫(kù)也包含了癌癥人群的數(shù)據(jù)。
今天我們就為大家做一個(gè)含有癌癥人群數(shù)據(jù)的公共數(shù)據(jù)庫(kù)匯總,當(dāng)然這是不完全匯總,還請(qǐng)大家見諒。

癌癥人群公共數(shù)據(jù)庫(kù)匯總

1.SEER數(shù)據(jù)庫(kù)
2.MIMIC數(shù)據(jù)庫(kù)
3.TCGA/GEO數(shù)據(jù)庫(kù)
4.NHANES數(shù)據(jù)庫(kù)
5.NHIS數(shù)據(jù)庫(kù)
6.HRS數(shù)據(jù)庫(kù)
7.CHARLS數(shù)據(jù)庫(kù)
......
一、SEER數(shù)據(jù)庫(kù)
SEER(Surveillance, Epidemiology, and End Results)數(shù)據(jù)庫(kù)是美國(guó)國(guó)家癌癥研究所(NCI)創(chuàng)建并維護(hù)的一個(gè)綜合性癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)庫(kù)。
它于1973 年建立,旨在收集關(guān)于癌癥發(fā)病率、治療和生存率等方面的詳細(xì)信息,里面包括了各式各樣的腫瘤類型,如肺癌、乳腺癌、胃癌等;還提供了各式各樣的臨床資料,如性別、年齡、TNM 分期等,以用于癌癥流行病學(xué)研究和臨床醫(yī)學(xué)研究。
獲?。?/span>通過數(shù)據(jù)庫(kù)申請(qǐng)?jiān)S可后免費(fèi)使用
10發(fā)文量:pubmed檢索發(fā)文量高達(dá)22462
官網(wǎng)鏈接:https://seer./
看兩篇文獻(xiàn):
二、MIMIC數(shù)據(jù)庫(kù)
MIMIC(Medical Information Mart for Intensive Care)數(shù)據(jù)庫(kù)是由麻省理工學(xué)院(MIT)與貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心(Beth Israel Deaconess Medical Center)合作開發(fā)的一個(gè)公開可訪問的大型醫(yī)療數(shù)據(jù)庫(kù)。該數(shù)據(jù)庫(kù)包含了在貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心重癥監(jiān)護(hù)病房(ICU)患者的詳細(xì)健康數(shù)據(jù)。
盡管MIMIC數(shù)據(jù)庫(kù)的主要目標(biāo)是記錄ICU患者的綜合醫(yī)療信息,而非專門針對(duì)某一類疾病,如癌癥,但由于它包含的數(shù)據(jù)量龐大且覆蓋面廣,包含了大量癌癥患者的相關(guān)數(shù)據(jù)。
獲?。?/span>MIMIC數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)是免費(fèi)的,但是研究人員必須通過認(rèn)證培訓(xùn)、簽署并提交數(shù)據(jù)使用協(xié)議、提交訪問申請(qǐng)獲得批準(zhǔn)即可下載數(shù)據(jù)
官網(wǎng)鏈接:https://mimic./
10發(fā)文量:pubmed檢索發(fā)文量94
文獻(xiàn):
三、TCGA/GEO數(shù)據(jù)庫(kù)
TCGA(The Cancer Genome Atlas,癌癥基因組圖譜)是由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)和國(guó)家癌癥研究所(NCI)資助創(chuàng)建的一個(gè)龐大的癌癥基因組項(xiàng)目,關(guān)注與癌癥的發(fā)生和發(fā)展相關(guān)的分子突變圖譜,集成了多種腫瘤類型的基因數(shù)據(jù)、臨床數(shù)據(jù)和圖片數(shù)據(jù)。
TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)匯集了來(lái)自多種癌癥的DNA測(cè)序(包括全基因組測(cè)序和外顯子組測(cè)序)、RNA測(cè)序、甲基化分析、拷貝數(shù)變異、單核苷酸多態(tài)性(SNP)基因分型、蛋白質(zhì)表達(dá)等多種類型的數(shù)據(jù)。
獲?。汗_免費(fèi)下載
下載鏈接:https://portal.gdc./
10發(fā)文量:pubmed檢索發(fā)文量26223篇
文獻(xiàn):
GEO(Gene Expression Omnibus,基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù))是由美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI) 維護(hù)的公共基因表達(dá)數(shù)據(jù)資源,收錄了世界各國(guó)研究機(jī)構(gòu)提交的基因表達(dá)數(shù)據(jù),主要包括腫瘤、非腫瘤、芯片、NGS、差異分析、分子驗(yàn)證等各種公開數(shù)據(jù)。
獲?。汗_免費(fèi)下載
官網(wǎng)鏈接:https://www.ncbi.nlm./geo/
近10年發(fā)文量:pubmed檢索發(fā)文量13275篇
文獻(xiàn):
四、NHANES數(shù)據(jù)庫(kù)
NHANES(National Health and Nutrition Examination Survey,國(guó)家健康與營(yíng)養(yǎng)檢查調(diào)查)是由美國(guó)疾病控制與預(yù)防中心(CDC)的國(guó)家健康統(tǒng)計(jì)中心(NCHS)開展并管理的一項(xiàng)重要的健康相關(guān)調(diào)查。調(diào)查的目的是評(píng)估美國(guó)成年人口和兒童的健康與營(yíng)養(yǎng)狀況,為公共政策、科研及公眾健康倡議提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
NHANES始于1960年,是一項(xiàng)基于人群的橫斷面調(diào)查,自1999年以來(lái)每年對(duì)美國(guó)境內(nèi)15個(gè)縣約5000人各個(gè)年齡段人群進(jìn)行調(diào)查。數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)容涵蓋人口學(xué)、社會(huì)經(jīng)濟(jì)學(xué)、膳食、健康相關(guān)的問題,以及體格檢查(醫(yī)學(xué)檢查、口腔檢查、身體測(cè)量和實(shí)驗(yàn)室檢測(cè))。
NHANES數(shù)據(jù)庫(kù)中包含針對(duì)癌癥人群的數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)可以用于研究癌癥的流行率、風(fēng)險(xiǎn)因素以及與其他健康指標(biāo)的關(guān)系。
獲?。?/span>數(shù)據(jù)庫(kù)完全開放免費(fèi)下載,且每?jī)赡旮乱淮巍?/span>
官網(wǎng)鏈接:https://www./nchs/nhanes/index.htm
10發(fā)文量:pubmed檢索發(fā)文量4986篇
文獻(xiàn):
五、NHIS數(shù)據(jù)庫(kù)
NHIS(National Health Interview Survey,國(guó)家健康訪談?wù){(diào)查)是由美國(guó)國(guó)家健康統(tǒng)計(jì)中心(NCHS)組織執(zhí)行的,自1957年開始對(duì)全美國(guó)人群進(jìn)行健康相關(guān)指標(biāo)的調(diào)查,目前每年發(fā)放一輪數(shù)據(jù),每輪的人群數(shù)目在3萬(wàn)左右。
其涵蓋了社會(huì)學(xué)基礎(chǔ)參數(shù)、健康/疾病狀況、健康相關(guān)行為、醫(yī)療服務(wù)使用史等內(nèi)容。對(duì)于癌癥人群,癌癥類型、診斷時(shí)間、治療方法以及癌癥對(duì)健康和生活質(zhì)量的影響等數(shù)據(jù),但沒有過于具體的臨床指標(biāo)(例如腫瘤具體分期、亞型)。
獲?。?/span>數(shù)據(jù)庫(kù)完全開放免費(fèi)下載
官網(wǎng)鏈接:https://www./nchs/nhis/
近10年發(fā)文量:pubmed檢索發(fā)文量1650篇
文獻(xiàn)
六、HRS數(shù)據(jù)庫(kù)
HRS(Health and Retirement Study,健康與退休研究)是由美國(guó)密歇根大學(xué)社會(huì)研究所(Institute for Social Research, ISR)負(fù)責(zé)實(shí)施的一項(xiàng)長(zhǎng)期縱向研究,旨在調(diào)查美國(guó)50歲及以上人群的健康、經(jīng)濟(jì)狀況、退休和家庭結(jié)構(gòu)等多個(gè)方面的信息。
該研究自1992年開始,每?jī)赡赀M(jìn)行一次數(shù)據(jù)收集。調(diào)查內(nèi)容包括收入和財(cái)富、健康、意識(shí)和醫(yī)療服務(wù)使用、工作和退休以及與家人聯(lián)系等內(nèi)容。2006年以來(lái)數(shù)據(jù)收集擴(kuò)展至生物標(biāo)志物、遺傳學(xué)、以及心理學(xué)和社會(huì)背景等相關(guān)內(nèi)容。
HRS數(shù)據(jù)庫(kù)中,有癌癥人群健康狀況的數(shù)據(jù),包括癌癥診斷、治療和其它健康相關(guān)信息。
獲?。?/span>注冊(cè)后免費(fèi)使用,而限制性數(shù)據(jù)需單獨(dú)應(yīng)用程序獲取。
官網(wǎng)鏈接https://hrs.isr./
10發(fā)文量:pubmed檢索發(fā)文量1113篇
文獻(xiàn):
七、CHARLS數(shù)據(jù)庫(kù)
中國(guó)健康與養(yǎng)老追蹤調(diào)查(China Health and Retirement Longitudinal Study, CHARLS)旨在收集一套代表中國(guó)45歲及以上中老年人家庭和個(gè)人的高質(zhì)量微觀數(shù)據(jù),用以分析我國(guó)人口老齡化問題,推動(dòng)老齡化問題的跨學(xué)科研究。
CHARLS全國(guó)基線調(diào)查于2011年開展,覆蓋150個(gè)縣級(jí)單位,450個(gè)村級(jí)單位,約1萬(wàn)戶家庭中的1.7萬(wàn)人。這些樣本以后每?jī)傻饺曜粉櫼淮?,調(diào)查結(jié)束一年后,數(shù)據(jù)將對(duì)學(xué)術(shù)界展開。目前已有5期數(shù)據(jù)2011(wave 1)、2013(wave2)、2015(wave 3)以及2018(wave 4),2020(wave 5)。
獲?。?/span>申請(qǐng)?jiān)S可后免費(fèi)使用
官網(wǎng)鏈接:https://charls.pku.edu.cn/
近10年發(fā)文量:pubmed檢索發(fā)文量42篇
文獻(xiàn):

本文分享到這里了,由鄭老師團(tuán)隊(duì)統(tǒng)計(jì)師撰寫

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