清朝光緒二十年（西元1894年），甲午戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)，清朝的北洋水師全軍覆沒。陸軍方面的表現(xiàn)則比海軍還要拉胯。所以迫于壓力之下，蜻蜓被迫割讓遼東半島和臺(tái)灣、澎湖等地給日本，并需要賠償日本大量賠款。當(dāng)然，在沙俄等列強(qiáng)的干涉之下，日本把遼東半島還給了清朝，同時(shí)又勒索走三千萬兩白銀。

整個(gè)甲午戰(zhàn)爭(zhēng)，日本雖然也遭遇了摩天嶺、田莊臺(tái)這些區(qū)域的清軍抵抗。但總的來說，這種抵抗程度對(duì)日本人來說還是可以接受的。而清朝割讓臺(tái)灣以后，日本的軍政人員普遍認(rèn)為，接收臺(tái)灣的軍政是很容易的事情。不曾想在臺(tái)灣，日本人遭到了嚴(yán)重的抵抗。這種抵抗甚至要比之前和清朝正規(guī)軍交戰(zhàn)還要嚴(yán)重。

1、基隆淪陷

清廷割讓臺(tái)灣的消息傳到臺(tái)灣以后，臺(tái)灣士紳對(duì)于日本的統(tǒng)治并不接受，所以臺(tái)灣士紳決定成立一個(gè)名義上獨(dú)立的地方政權(quán)，來對(duì)抗日本人。于是以年號(hào)為“永清”的抗日政權(quán)出現(xiàn)了。

所謂“永清”，清在這里指的是中國(guó)，永清，其實(shí)就是代表永遠(yuǎn)屬于中國(guó)。

當(dāng)時(shí)臺(tái)灣士紳推舉清朝臺(tái)灣巡撫唐景崧?lián)?/span>“永清”政府的總統(tǒng)，并統(tǒng)御臺(tái)灣的抗日力量抗擊日本人。之后臺(tái)灣民眾和日本人開始了長(zhǎng)達(dá)五個(gè)月的戰(zhàn)爭(zhēng)。這場(chǎng)戰(zhàn)爭(zhēng)就是中國(guó)近代史上的乙未戰(zhàn)爭(zhēng)。一般認(rèn)為，這也是臺(tái)灣省歷史上規(guī)模最大的異常戰(zhàn)爭(zhēng)。

當(dāng)時(shí)負(fù)責(zé)帶領(lǐng)日本近衛(wèi)師團(tuán)進(jìn)駐臺(tái)灣的是日本的北白川宮能久親王。日本軍隊(duì)在臺(tái)灣登陸以后。臺(tái)灣軍民開始自發(fā)進(jìn)行抗日，并和日本軍隊(duì)交戰(zhàn)。

1895年5月底，日本軍出動(dòng)五千多人在基隆東北部登陸。登陸后的日本人發(fā)現(xiàn)了一個(gè)嚴(yán)重的問題，那就是日本人手里的地圖誤差太大，影響行軍，于是日本人派遣偵察隊(duì)負(fù)責(zé)勘察地形。結(jié)果在第二天，這支日本偵查部隊(duì)遭遇臺(tái)北附近的廣東義軍，雙方交戰(zhàn)。這支日本軍的偵查部隊(duì)被臺(tái)灣軍消滅。這一勝利很大程度上鼓舞了臺(tái)灣軍民的士氣。

不過之后隨著日本軍的大部隊(duì)趕到，基隆周邊的抗日軍民經(jīng)過和日本人的惡戰(zhàn)，最終因?yàn)槲淦餮b備問題，而被迫撤離戰(zhàn)斗。

到了6月3日中午，北白川宮能久親王帶領(lǐng)四千多日本士兵開始進(jìn)攻基隆港。并且日本海軍將領(lǐng)東鄉(xiāng)平八郎也用軍艦輔助日本陸軍。隨著日本陸軍攻入基隆城內(nèi)，臺(tái)灣軍民開始和日本軍進(jìn)行巷戰(zhàn)。最終因?yàn)槿哲娀鹆μ?，所以臺(tái)灣軍民被迫撤退到獅球嶺炮臺(tái)。而炮臺(tái)的守軍因?yàn)槿狈τ?xùn)練，加上基隆淪陷，所以獅球嶺守軍的戰(zhàn)力也沒能得到太好的發(fā)揮。所以炮臺(tái)也很快失守。

此時(shí)臺(tái)北城內(nèi)也陷入局勢(shì)混亂的狀態(tài)。唐景崧無力制約這個(gè)局面，于是只好逃離臺(tái)灣。

2、八卦山戰(zhàn)役

基隆丟失以后，日本委任的臺(tái)灣總督樺山資紀(jì)也抵達(dá)臺(tái)灣，并在隨后不久抵達(dá)臺(tái)北，成立總督府。

唐景崧出逃以后，臺(tái)灣抗日軍民擁戴劉永福擔(dān)任“永清”政府新的總統(tǒng)。在這之前，臺(tái)中地區(qū)也被日本人占領(lǐng)。

劉永福命人在八卦山一帶部署兵力，頂住日本軍南下。而日本軍在八卦山一帶遭遇臺(tái)灣居民的激烈抵抗，這一戰(zhàn)役被視為乙未戰(zhàn)爭(zhēng)中最激烈的一戰(zhàn)，雙方都遭到了極大的損失：日本方面，日本軍隊(duì)的山根少將被臺(tái)灣軍隊(duì)打死，北白川宮能久親王也在戰(zhàn)斗中受傷，并在之后不久因?yàn)橹貍鴨噬?/span>——兩個(gè)日本高級(jí)將領(lǐng)，死于這一戰(zhàn)役。而這個(gè)成就，在甲午戰(zhàn)爭(zhēng)中并未出現(xiàn)。

不過，這一戰(zhàn)，也導(dǎo)致臺(tái)灣的抗日武裝遭到了毀滅性消耗。之后兩個(gè)月的時(shí)間里，日本軍和臺(tái)灣軍又爆發(fā)了一系列的戰(zhàn)役，但其激烈程度，遠(yuǎn)不如八卦山戰(zhàn)役。

八卦山戰(zhàn)役的兩個(gè)月后，劉永福眼看無力扭轉(zhuǎn)局面，于是也離開了臺(tái)灣。隨后不久，日本軍占領(lǐng)臺(tái)南，整個(gè)臺(tái)灣被日本占領(lǐng)，乙未戰(zhàn)爭(zhēng)也隨之結(jié)束。

而日本對(duì)整個(gè)臺(tái)灣的統(tǒng)治也隨之開始。

不過，在這之后的很多年時(shí)間里，臺(tái)灣社會(huì)的抗日運(yùn)動(dòng)依舊廣泛存在。