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Nature:新機(jī)理,光酶催化構(gòu)建C-N鍵

 化學(xué)加網(wǎng) 2024-10-16

導(dǎo)讀

近日,美國普林斯頓大學(xué)(Princeton UniversityTodd K. Hyster課題組報(bào)道了一種光酶催化烯烴的氫-胺化反應(yīng),其通過Baeyer-Villiger單氧酶實(shí)現(xiàn)了一系列2,2-二取代吡咯烷的合成。作者通過五輪蛋白工程得到一個(gè)突變體,使得產(chǎn)物的產(chǎn)率和立體選擇性都非常出色。與依賴胺基或烯烴氧化構(gòu)建C-N鍵的相關(guān)光化學(xué)氫-胺化反應(yīng)不同,此轉(zhuǎn)化利用了還原生成的芐基自由基與氮原子的孤對(duì)電子之間的空間相互作用來構(gòu)建C-N鍵。這種獨(dú)特的C-N鍵構(gòu)建機(jī)理在小分子催化中是難以實(shí)現(xiàn)的,為化學(xué)合成中未解決的挑戰(zhàn)提供了獨(dú)特的解決方案。相關(guān)成果發(fā)表在Nature上,文章鏈接DOI:10.1038/s41586-024-08138-w。

  

(圖片來源:Nature

正文

由于氮原子普遍存在于小分子藥物和農(nóng)用化學(xué)品中,因此發(fā)展高效的碳氮鍵構(gòu)建方法在現(xiàn)代合成化學(xué)中至關(guān)重要。烯烴的氫-胺化是利用非活化烯烴構(gòu)建碳氮鍵的一種原子經(jīng)濟(jì)的合成策略。然而,在制備全取代的碳立體中心時(shí),這些反應(yīng)很難實(shí)現(xiàn)不對(duì)稱反應(yīng)過程。最近,美國普林斯頓大學(xué)Todd K. Hyster課題組利用Baeyer-Villiger單氧酶實(shí)現(xiàn)了一種光酶催化烯烴的氫-胺化反應(yīng),構(gòu)建了一系列2,2-二取代吡咯烷。通過五輪蛋白工程得到的蛋白突變體,可以以良好的產(chǎn)率和立體選擇性得到產(chǎn)物。機(jī)理方面,此轉(zhuǎn)化利用了還原生成的芐基自由基與氮原子的孤對(duì)電子之間的空間相互作用來構(gòu)建C-N鍵,這與傳統(tǒng)的利用胺基或烯烴氧化構(gòu)建C-N鍵有所不同(Figure 1)。歡迎下載化學(xué)加APP到手機(jī)桌面,合成化學(xué)產(chǎn)業(yè)資源聚合服務(wù)平臺(tái)。

  (圖片來源:Nature

首先,作者以帶有端烯的苯胺1為模板底物,探索了利用其構(gòu)建2,2-雙官能團(tuán)化吡咯烷的轉(zhuǎn)化(Figure 2)。通過對(duì)多種不同的黃素酶進(jìn)行篩選,作者發(fā)現(xiàn)當(dāng)使用AcCHMOAcinetobacter calcoaceticus)時(shí)可以有效的實(shí)現(xiàn)5-exo-trig環(huán)化,以1%的產(chǎn)率,55:45 er得到吡咯烷產(chǎn)物2,且并沒有觀察到6-endo-trig產(chǎn)物3。而對(duì)于其它的酶,包括苯乙烯氧化酶、D-氨基酸氧化酶、單胺氧化酶、膽固醇氧化酶、氯氧化酶等均不能實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化。由于利用蛋白質(zhì)工程可以有效改善反應(yīng)的產(chǎn)率和立體選擇性,因此作者利用軟件進(jìn)行結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),將酶通過五輪蛋白工程得到一個(gè)突變體,其可以以97%的產(chǎn)率,95:5 er,選擇性的得到吡咯烷產(chǎn)物2。分子動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)表明R490EI490TA479H三個(gè)位點(diǎn)位于一個(gè)環(huán)狀區(qū),是酶的活性位點(diǎn)。這種在遠(yuǎn)端位點(diǎn)突變的設(shè)計(jì)在打開催化活性位點(diǎn)和實(shí)現(xiàn)位點(diǎn)與底物的接觸中起到至關(guān)重要的作用。隨后,作者測(cè)試了無細(xì)胞狀態(tài)下的酶催化活性。當(dāng)將催化劑的載量降為0.04 mol %時(shí),仍可以以17 %的產(chǎn)率得到產(chǎn)物4TON = 436),且立體選擇性得到保持。此外,作者還發(fā)現(xiàn)當(dāng)加入1.0 equiv NADP+可以抑制反應(yīng),因此其可以作為有效的抑制劑。

  

(圖片來源:Nature

在最優(yōu)反應(yīng)條件下,作者對(duì)此轉(zhuǎn)化的底物范圍進(jìn)行了考察Figure 3。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,一系列不同取代的苯胺和苯乙烯均可良好兼容,以14-99%的產(chǎn)率得到相應(yīng)的產(chǎn)物2-26。其中,富電子芳烴通常提供更高的產(chǎn)率和選擇性(24-10、13-20)。苯胺一側(cè)(10)和苯乙烯部分(19)上的大取代基,如萘,可以在沒有降低產(chǎn)率和對(duì)映選擇性的情況下進(jìn)行轉(zhuǎn)化。此外,缺電子的氮雜環(huán)同樣是耐受的(11-1221),其克服了Br?nsted酸催化環(huán)化的局限性。遺憾的是,環(huán)化反應(yīng)對(duì)雜環(huán)取代較敏感,反應(yīng)會(huì)受到影響。而利用蛋白質(zhì)工程可以克服這些限制。相應(yīng)的同系化底物可以實(shí)現(xiàn)6-exo-trig環(huán)化,以13%的產(chǎn)率得到產(chǎn)物22,并具有良好的對(duì)映選擇性(78:22 er)。這是一個(gè)有趣的例子,因?yàn)楫?dāng)使用光氧化還原催化劑時(shí),這種類型的底物通常會(huì)經(jīng)歷1,5-HAT而非環(huán)化。

此外,利用此策略還可以以中等產(chǎn)率(42%)和對(duì)映體比(27:73)得到修飾的吡咯烷骨架23。接下來,作者利用此方法制備了三種芳基吡咯烷原料藥的α-甲基化類似物。包括TRK抑制劑GNF-862541的甲基化吡咯烷片段2485%, 94:6 er);改良的原肌球蛋白抑制劑片段α-larorectinib 2677%, 75:25)和其相關(guān)結(jié)構(gòu)2525%, 73:27)。這些合成過程表明,利用此方法可以很容易的制備通常需要多步合成的取代類似物。

  

 (圖片來源:Nature


接下來,作者對(duì)反應(yīng)機(jī)理進(jìn)行了探索(Figure 4)。作者發(fā)現(xiàn)該反應(yīng)具有一定的誘導(dǎo)期,且不是由反應(yīng)物的氧化來啟動(dòng)反應(yīng),誘導(dǎo)期的觀察表明氧化黃素不是自由基引發(fā)的原因,而是需要光還原才能發(fā)生反應(yīng)。而當(dāng)使用連二亞硫酸鈉還原酶進(jìn)行催化反應(yīng)時(shí),在沒有誘導(dǎo)期的情況下以74 %的產(chǎn)率,95:5 er得到產(chǎn)物。UV-Vis光譜表明,連二亞硫酸鈉還原酶與光照還原酶是等效的。因此,此反應(yīng)的誘導(dǎo)期是經(jīng)歷了光化學(xué)還原FADFADhq。此外,作者利用控制實(shí)驗(yàn)排除了能量轉(zhuǎn)移機(jī)理的可能?;谏鲜鰧?shí)驗(yàn)結(jié)果,作者得出反應(yīng)首先經(jīng)歷了烯烴被FADhq*還原。由于FADhq*E0-2.26 V vs. SCE,因此其無法還原α-甲基苯乙烯(Ered = -2.6 V vs. SCE)。但是正電性的活性位點(diǎn)可以減小反應(yīng)物的還原電勢(shì),而且可以穩(wěn)定FADsq-。這種陰離子具有很強(qiáng)的堿性,能夠快速且不可逆的脫質(zhì)子,從而形成芐基自由基。    

  

 (圖片來源:Nature

作者通過研究發(fā)現(xiàn),芐基自由基和苯胺之間的相互作用會(huì)影響氧化還原過程,且這種作用關(guān)系在以往的報(bào)道中還未出現(xiàn)。由于氮原子的孤對(duì)電子和自由基之間的超共軛作用,可以有效增加SOMO軌道的能量,使自由基更容易被氧化。因此此轉(zhuǎn)化經(jīng)歷了一種與小分子催化完全不同的氫-胺基化機(jī)理。其利用芐基自由基與氮原子的孤對(duì)電子之間的空間相互作用來降低酶催化位點(diǎn)的自由基氧化還原電勢(shì)從而構(gòu)建C-N鍵。

  


總結(jié)

Todd K. Hyster課題組報(bào)道了一種高度選擇性的光酶催化反應(yīng)過程,立體選擇性的實(shí)現(xiàn)了烯烴的氫-胺化反應(yīng)?;趯?shí)驗(yàn)和計(jì)算結(jié)果,作者得出該反應(yīng)經(jīng)歷了一種全新的C-N鍵形成機(jī)理,利用還原生成的芐基自由基與氮原子的孤對(duì)電子之間的空間相互作用實(shí)現(xiàn)了C-N鍵的構(gòu)建。這種C-N鍵形成的新機(jī)理突出了利用酶實(shí)現(xiàn)新轉(zhuǎn)化的潛力,其可有效解決化學(xué)合成中的挑戰(zhàn)。

文獻(xiàn)詳情:

Emergence of a distinct mechanism of C–N bond formation in photoenzymes. 

Felix C. Raps, Ariadna Rivas-Souchet, Chey M. Jones, Todd K. Hyster*.

Nature, 2024

https:///10.1038/s41586-024-08138-w.


  

  

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