晚間，收到還在海外的朋友說(shuō) TBtools 幫了他大忙... 當(dāng)然我完全沒(méi)想到是 他用 TBtools RNAseq 系列插件更新了課題組多年數(shù)據(jù)，挖到了不錯(cuò)的基因，也驗(yàn)證拿到了表型。細(xì)細(xì)討論才知道，主要原因是以前的參考基因組不完善，注釋也不行，結(jié)果不理想就放著吃灰。這個(gè)哥們運(yùn)氣很好，只是想隨便跑跑看，沒(méi)想到因?yàn)楦乱幌禄蚪M版本，用TBtools簡(jiǎn)單點(diǎn)點(diǎn)練手卻挖到了不錯(cuò)的故事.... 這一系列插件是眾籌開(kāi)發(fā)，曾經(jīng)完全開(kāi)放，諸多原因又關(guān)閉開(kāi)放，現(xiàn)在已經(jīng)不在我的覆蓋范疇，由朋友去折騰。上次到在貴州一起吃了個(gè)飯，提及他們做了大量?jī)?yōu)化更新，我覺(jué)得挺好。有時(shí)候，我們需要的是好用的能用的工具，花錢(qián)也行。

--CJ

凌晨錄制的講演，年前填補(bǔ)兩年前的坑。

直接在 TBtools 中開(kāi)展轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析，尤其上游，從「原始測(cè)序數(shù)據(jù)（.sra/.fastq）」到「基因表達(dá)量與差異表達(dá)基因」。

如此，任何人都能輕松地直接在 Windows 下 或者 MacOS 下開(kāi)展 RNAseq 數(shù)據(jù)分析。

為什么要掌握轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析技能？

?時(shí)時(shí)刻刻看遍基因表達(dá)：

    ?自主完成常規(guī)轉(zhuǎn)錄組分析，隨時(shí)可看基因表達(dá)

?充分利用已有數(shù)據(jù)：

    ?1）公共數(shù)據(jù)庫(kù) SRA ；

    ?2）實(shí)驗(yàn)室已有舊數(shù)據(jù)

?更新已有結(jié)果：

    ?1）基因組序列更新了；

    ?2）基因組注釋更新了。

為什么要開(kāi)發(fā)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系列插件？

    1. 認(rèn)為好玩，值得一試

    2. 一件往事：答聯(lián)合組會(huì)所獲一問(wèn)

    3. 解決問(wèn)答煩惱

    4. 沒(méi)有服務(wù)器，課題太忙

    5. 繼續(xù)拆除常規(guī)數(shù)據(jù)分析門(mén)檻

TBtools 有別于其他生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析解決方案的地方

本地化，隨時(shí)可以使用 容易掌握，且不容易忘卻 兩年前嘗試眾籌開(kāi)發(fā) TBtools RNAseq 系列插件，也寫(xiě)了系列教程。但不夠直觀。當(dāng)時(shí)便提到要組織視頻使用教程。一直沒(méi)有時(shí)間，近日碎片化時(shí)間較多，決定填坑。